A mi me paso algo similar, si, despues de dejar que la ecu se ajuste (es un proceso rapido, unos minutos de ralenti y una salida de 5 min. y ya esta) sigues con problemas, y por que decias que tuviste problemas con la bateria, revisa el sistema de carga. Si no es eso, puede ser lo que me paso a mi que fue un problema con la IAC. en el manual tecnico q hay en el foro salle donde esta ubicada. Sigue las indicaciones para probarla y ademas limpiala.
suerte
Algo similar me ocurrió un día que desconecté la batería para hacer unas modificaciones a las luces y a una segunda batería, al conectarla y arrancarla todo bien, sin embargo en un minuto se fueron las revoluciones a cero y se apagó, intente acelerarla, encendiendo y apagando el clima y nada, como estoy tomando un curso de mecánica me acordé de la válvula de marcha mínima que es precisamente la que se encarga de acelerar el carro cuando se acaba de encender, es la que se encarga de acelerar un poco cuando se prende el clima y en pocas palabras es la que mantiene funcionando el motor cuando no estamos presionando el acelerador. Se encuentra abajo de la toma de admisión del aire, justo donde se empata el ducto de plastico que viene del filtro de aire al cuerpo de aluminio de la admisión, es un motor de pasos que mueve un sinfín y este a su vez un embolo de plastico que permite dejar pasar más o menos una cantidad de aire a través de un pequeño ducto diseñado para tal, aun cuando la mariposa del acelerador este cerrada, tiene solo dos tornillos de cruz, cuando la quité observé que tenía el embolo lleno de carbón, la desarmé y limpié a conciencia, de hecho cuando te hacen la afinación, esa válvula te la debieran de limpiar en lo que incluyen como lavado de cuerpo de aceleración, pero no es así; por lo que una vez que quedó limpia la armé, la monté y probé y está la camioneta como nueva, suavecita y ya no se jalonea o respinga. Espero te sirva la información.
Ya se soluciono el problema....todo bien...efectivamente se quitó sola la "falla"... de hecho vengo regresando de un viaje de 1600 kms y todo perfecto...